Отдел учёта и экономики включает в себя три штатные единицы. В своей деятельности руководствуется действующим законодательством РФ, указами Президента РФ, постановлениями и распоряжениями Правительства РФ, приказами и распоряжениями Главного управления ветеринарии Омской области, приказами начальника учреждения и другими нормативными актами.

Основными задачами отдела являются:
- обеспечение необходимых экономических предпосылок для эффективной деятельности учреждения в целом;
- организация работ по обеспечению финансовыми ресурсами, изысканию внутренних трудовых, финансовых и других резервов экономического развития отделов учреждения;
- организация бухгалтерского учёта и контроля в учреждении с целью обеспечения рационального и экономического использования материальных, трудовых и финансовых ресурсов, активного воздействия на повышение эффективности хозяйственной деятельности отделов учреждения.